Le Bureau de Recherche et de Défense sur le Paranormal a été fondé en 1944, en réaction aux expériences occultes menées par les nazis, puis par les Soviétiques. Sa fonction : surveiller, étudier, et circonscrire les événements surnaturels survenant partout dans le monde. Son agent vedette est Hellboy, dont les enquêtes sont relatées dans la série éponyme, chez le même éditeur. Sur les côtes du Rhode Island, dans une bâtisse en ruine, Abe Sapien retrouve sa femme, morte noyée au cours du XIXe siècle. Au même moment, le BPRD, encore marqué par le fléau des grenouilles, emménage dans ses nouveaux locaux : une ancienne base de recherche gouvernementale dans laquelle on aurait enterré vivant un scientifique nazi, il y a 50 ans de cela...