Dan et Amy ont découvert lors de leur précédente aventure que tous les objets qu'ils ont volés pour Vesper I sont des plans et des éléments d'une machine de l'apocalypse sur laquelle travaillait Archimède ! Désormais, ils savent que Vesper I a pour dessein de détruire des millions de vies et prendre le pouvoir ! Dan et Amy décident de l'en empêcher... Mais l'ennemi est partout ! Ils apprennent que l'horrible Isabel Kabra est Vesper II, et qu'elle est en route pour Washington DC. Les voici sur une nouvelle piste, direction le musée d'Histoire Naturelle...