En cette fin du XVIIIe siècle, Ian Flibus se préparait à un brillant avenir d'officier dans la marine, mais il choisit plutôt de rejoindre un équipage de pirates, convaincu d'être appelé par les destin. Impressionné par ses états de service malgré son jeune âge, le capitaine Kutter lui offre aussitôt de partager le commandement de son bateau. Ian Flibus et ses nouveaux amis sont toutefois loin de se douter de ce qui les attend réellement en écumant les mers. A la suite d'une collision avec le mât d'une épave, ils sont frappés par un sortilège et doivent désormais vivre sous l'influence de forces surnaturelles. Ils les combattront avec l'aide de leurs deux savants, qui ont aménagé le navire en véritable forteresse. Leur soif de liberté et d'aventures les entraînera alors vers la légendaire île aux Treize Os, où serait enterré un trésor maudit.