À Shinjuku, les crimes font partie du quotidien. Mais il y a un nom dont la simple évocation fait trembler les plus grands malfrats. City Hunter est une légende qui prend un malin plaisir à interférer dans les affaires de ces individus. Derrière ce nom se cache en réalité un tandem redoutablement efficace: Ryo Saeba, le nettoyeur et Hideyuki Makimura, un ancien policier.Lorsque ce dernier est tué par une organisation criminelle, son coéquipier promet de veiller sur sa soeur Kaori. De ce serment, naîtra un duo de choc!