Au Japon, une légende urbaine circule, celle d'un mystérieux "Ange de la mort" qui hanterait les lycées. Cet ange a un nom : Boogiepop. Et la légende n'en est pas une... Alors que le passé de l'infirmière Igarashi et d'Akizuki est révélé, la nature de l'" ennemi du monde " qui sévit dans le lycée se précise et le combat final se dessine inéluctablement...