Usagi Yojimbo, notre lapin Ronin, se retrouve malgré lui entrainé dans une lutte entre chefs de gangs qui souhaitent prendre le contrôle d'une ville nommée Enfer. Avec l'aide de maître Kato, Usagi prendra part à la lutte, ce qui ne sera pas sans conséquences !

Usagi continue ses voyages, affrontant un Nukekubi - sorte de vampire - , il vient en aide à un samouraï déchu en quête de rédemption, et croisera à nouveau la route du démon Jei !